小儿推拿的穴位与成人推拿的穴位有些是相同的，如百会、足三里等；有些穴位是小儿所特有的穴位，如三关、六腑等成线状；有的如板门、内八封等成面状。小儿百脉汇于两掌。因此，手掌前后的穴位在治疗中常用做主穴。
现将小儿推拿常用穴位介绍如下：
百会位置：两耳尖直上，头顶中央。操作：用拇指指面按或揉，按、揉百会20～30次。主治：头痛、脱肛、慢性消化不良。
天门位置：两眉间中点起，直上至前发际成一直线。操作：两手拇指桡侧自下而上交替直推，称开天门，20～40次。主治：头痛、发热、感冒、惊吓等。
坎宫位置：自眉头沿眉弓上缘至眉梢成一直线。操作：术者两手四指扶住患儿头部，两拇指指面由眉头沿眉棱骨分推至两眉梢，称为推坎宫，20～40次。主治：感冒、头痛、头晕、目赤痛。
太阳位置：两眉外端的后方凹陷处，又名左太阳、右太阳。操作：用拇指指端在穴位上旋转揉运，称运太阳，向眼睛方向为补，向耳后方向为泻；用两手拇指指面自两太阳穴向耳后方向推，称推太阳，20～50次。主治：感冒、发热、头痛、恶寒、目赤痛。
耳后高骨位置：耳后高骨微突处凹陷中。操作：以中指按于穴位上揉运之，称运耳后高骨，20～50次。主治：伤风感冒、惊风、抽搐、烦躁不安。
乳旁位置：乳头旁2分(一横指)。操作：用中指或示指揉之，称揉乳旁，100～300次。主治：胸闷、呕吐、咳嗽、痰鸣。
腹用掌心或四指在腹部做顺时针方向(或逆时针方向)抚摩，称摩腹，5～10分钟，或更长时间。主治：腹胀、腹痛、呕吐、泄泻、便秘、消化不良。
肚角位置：在脐旁、腹部两侧的肚筋。操作：用拇、示、中三指，自深处拿住肚筋弹之，称拿肚角，l～3次。主治：腹痛、腹胀、泻痢。
天柱骨位置：项后，枕骨下，后发际正中至大椎穴成一直线。操作：用示指或中指，自上而下直推，称推天柱骨，200～800次。主治：呕吐、恶心、项强、咽痛。
七节骨位置：从尾骨端至第四腰椎成一直线。操作：用示、I中指指腹，自尾椎端直上推至第四腰椎，称推上七节骨；用示、中指指腹，自第四腰椎直下推至尾骨端，称推下七节骨，50～500次。推上七节骨有温阳止泻作用，推下七节骨有泻热通便作用。主治：泄泻、便秘、痢疾、腹胀满。
龟尾位置：尾椎骨端。操作：用示指或中指端按揉之，称揉龟尾，100~300次。主治：泄泻、便秘、脱肛、痢疾、遗尿。
脊位置：从大椎直下到尾端成一直线。操作：先在背部由上而下轻轻摩至腰骶部3遍，使肌肉放松，再用捏脊法自龟尾向上捏至大椎，称捏脊；用示、中指指腹从大椎向下直推至龟尾，称推脊，捏3～5遍，推100～300次。主治：疳积、伤食、腹泻、便秘、呕吐、遗尿、脱肛、夜啼、发热、惊风。
脾经位置：拇指桡侧自指尖至指根处，又称脾土。操作：将小儿拇指微屈，自指尖推向指根为补，称补脾土；小儿拇指伸直自指根推向指尖为清，称清脾经；拇指伸直，从指尖到指根来回推为平补平泻，称清补脾经，100～500次。主治：消化不良、泄泻、疳积、惊厥等。
肝经位置：示指末节罗纹面，亦称肝木。操作：自示指掌面末节指横纹起推向指尖为清，称清肝经，亦称平肝；反之为补，在临床应用中肝经宜清不宜补，100～500次。主治：惊风、烦躁不安、五心烦热、目赤昏痛等。
心经位置：中指末节罗纹面。操作：自中指掌面末节指起推向指尖为清，称清心经，心经穴宜清不宜补，100～500次。主治：五心烦热、口舌生疮、小便赤涩、惊悸不安等。
肺经位置：无名指末节罗纹面。操作：自无名指掌面末节指纹起推至指尖为清，称清肺经，反之为补，称补肺经，100～500次。主治：感冒、发热、气喘、咳嗽等。
肾经位置：小指末节罗纹面，亦称肾水。操作：自掌根推至小指尖为补，称补肾经，反之为泻，100～500次，本穴一般不用泻法。主治：先天不足、久病体虚、五更泄泻、遗尿、咳嗽喘息、小便赤涩不利等。
大肠位置：示指桡侧缘，由指尖向虎口成一直线。操作：用拇指桡侧面，自指尖直推至虎口为补，称补大肠；反之为清，称清大肠；来回推为清补大肠，100～500次。主治：食积、便秘、肠热、泻泻、脱肛等。
板门位置：手掌大鱼际之平面。操作：用拇指或示指指腹，在大鱼际平面的中点揉之称运或揉板门，100～500次。主治：食欲不振、乳食积滞、呕吐、泄泻、腹胀等。
小天心位置：手掌大、小鱼际交接之中点凹陷处。操作：用拇指指甲掐揉之，称掐揉小天心；以示指或中指尖，或中指屈曲，以第一指关节突起处捣之，称捣小天心；用中指指端揉之，称揉小天心。掐揉5～30次，捣30～50次，揉100～300次。主治：惊风抽搐、烦躁不安、小便赤涩、夜啼、目赤痛等。
内劳宫位置：掌心中，屈指时当中指与无名指中间处。操作：以中指指端所指处揉之，称揉内劳宫，100～300次。主治．发热、烦渴、口疮、齿龈糜烂、虚烦内热。
内八封位置：以手掌中心内劳宫为圆心，从圆心至中指掌指关节横纹约2／3处为半径，画圆，八封穴即在此圆上，100～500次。主治：咳嗽、气喘、胸闷、呕吐、泄泻、腹胀、食欲不振。
四横纹位置：手掌面，除拇指外，四指第一指间关节横纹处。操作：以拇指指甲依次掐之并揉，称掐四横纹。以拇指桡侧自示指横纹推向小指横纹，称推四横纹。掐3～5次，推100～500次。主治：疳积、腹痛、腹胀、消化不良、气血不和、喘咳、口唇破裂。
大肠位置：示指桡侧缘，由指尖向虎口成一直线。操作：用右手拇指桡侧缘，自指间直推至虎口为补，称补大肠；反之为泻，称清大肠；来回推为清补，称清补大肠，100～500次。主治：泄泻、痢疾、脱肛、腹痛、便秘、肛门红肿。
十王位置：在两手十指指尖，又称十宣。操作：以拇指指甲依次掐之，称掐十王，100～500次。主治：高热、神昏、惊风、抽搐。
三关位置：臂桡侧，腕横纹至肘横纹成一直线。操作：示、中指并拢，用指腹从腕横纹起推至肘横纹，或用拇指桡侧推之，称推三关，100 500次。主治：营养不良、贫血、四肢无力、病后虚弱、疹出不透等。
天河水位置：前臂掌侧正中，自腕横纹至屈肘横纹成一直线。操作：用示、中二指指腹，自腕横纹推至肘横纹，称清天河水，100~500次。主治：外感发热、内热、潮热、烦躁不安、口渴、惊风等。
六腑位置：前臂尺侧，自肘横纹至腕横纹成一直线。操作：用示、中二指自肘横纹推至腕横纹，称退六腑，100～500次。主治：高热、烦躁、口渴饮冷、惊风、大便干燥。
箕门位置：大腿内侧，自膝上缘至腹股沟成一直线。操作：用示、中二指指腹，自膝内侧上缘直上，推至大腿根部，称推箕门。主治．小便赤涩不利、尿闭、水泻。